L'osmose inverse est généralement utilisée pour la déminéralisation de l'eau, car cette méthode de filtration couvre le champ d'application le plus large comme le montre le diagramme. La nanofiltration, elle, est utilisée pour réduire ou supprimer certains composants indésirables.
Contrairement à l'osmose inverse, la nanofiltration fonctionne à une pression plus faible, typiquement inférieure à 7 bars, ce qui entraîne une consommation d'énergie inférieure par rapport à une installation d'osmose inverse avec la même productivité.